Учёный из Севастополя починил «молекулярные часы» для изучения бактерий

«С помощью не очень сложного математического трюка можно связать модель эволюции и эмпирические данные изучения бактерий, чтобы проверить, правильно ли мы понимаем, как эволюционируют бактерии», — рассказал Шейнман.

«Главное отличие состоит в том, что бактерии постоянно обмениваются генами с помощью так называемого горизонтального переноса. Мы передаем гены только потомкам, родственникам не можем, а бактерии постоянно делают это. Например, гены устойчивости к антибиотикам: бактерии могут друг другу „рассказать“, как с ними бороться», — пояснил Шейнман.

«Молекулярные часы», где каждая мутация — это «тик», у одних идут быстрее, а у других медленнее. Поэтому, сравнивая геномы бактерий, мы видим мешанину из разных кусков, имеющих разную эволюционную историю. Получается, что геном — это сложносоставленная мозаика. Как узнать, где кончается один кусок и начинается другой? Бактерии об этом не «расскажут». Однако с помощью этого нового метода можно сравнить статистические свойства геномов и сравнить с тем, что предсказывает модель, попутно подогнав параметры модели. Таким образом стало возможным напрямую по бактериальным геномам оценить время расхождения бактериальных видов и оценить насколько часто они обмениваются генами после расхождения», — рассказал Шейнман.